lammps并行计算命令(lammps并行)

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LAMMPS（Large-scale Atomic/Molecular Massively Parallel Simulator）是一个用于模拟原子、分子和纳米尺度系统的开源软件。在LAMMPS中，并行计算通常是通过MPI（Message Passing Interface）实现的，这允许你将计算任务分配到多个处理器上。

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以下是一些基本的LAMMPS并行计算的命令：

1. **启动LAMMPS并行计算**：

- 使用mpirun或mpiexec启动LAMMPS。以下是一个使用mpirun的例子，假设你有4个处理器：

```bash

mpirun -np 4 lmp_mpi < in.lammps

```

或者使用mpiexec：

```bash

mpiexec -np 4 lmp_mpi < in.lammps

```

这里`-np 4`指定了使用的处理器数量，`< in.lammps`表示从标准输入读取LAMMPS输入文件`in.lammps`。

2. **在LAMMPS输入文件中指定并行选项**：

- 在LAMMPS的输入文件中，你可以使用`-partition`选项来指定并行计算的分区。以下是一个例子：

```lmp

-partition cpus 4

```

这将告诉LAMMPS使用4个处理器。

3. **在LAMMPS中设置并行计算的边界条件**：

- 使用`boundary`命令设置并行计算的边界条件，例如：

```lmp

boundary p p p

```

这意味着在所有三个方向上使用周期性边界条件。

4. **在LAMMPS中启动并行计算**：

- 在LAMMPS输入文件中，你可以使用`run`命令启动并行计算：

```lmp

run 1000

```

这将运行1000个时间步。

请注意，具体的命令和选项可能会根据你的系统配置和LAMMPS版本有所不同。在使用这些命令之前，请确保你已经正确安装了LAMMPS，并且熟悉你的并行计算环境。

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