光合作用产生的氧气来自于水分子(H₂O)。在光合作用的过程中,植物、藻类和某些细菌利用光能将水分子分解成氧气(O₂)、氢离子(H⁺)和电子(e⁻)。这个过程称为光解水。分解出来的氧气以气体的形式释放到大气中,而氢离子和电子则在光合作用的下一个阶段(即光合磷酸化)中被用来合成葡萄糖等有机物。以下是光解水的简化反应式:

\[ 2H_2O \xrightarrow{光能} 4H^+ + 4e^- + O_2 \]
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